Nein, es wird immer die Standard-Verbindung genommen. Das ist auch leider nicht ohne wesentlichen Aufwand zu ändern.
Ich weiß nicht, ob man MySQL-intern da irgendwie rumtricksen kann (durch Master-Slave-Krempel). Aber wenn ihr nur den Port aufmachen müsste, dass euer Webserver an den MySQL-Server kommt ... SO ein großes Loch ist das nicht.
Torben